著名微生物学家，教授、博士生导师、长江学者特聘教授，中国科学院院士（Member，CAS)，第三世界科学院院士（Fellow，TWAS），美国微生物科学院院士（Fellow，AAM）。现担任上海交通大学生命科学技术学院院长，武汉大学药学院院长，武汉生物技术发展研究院院长，微生物代谢国家重点实验室主任，中国微生物学会理事长，中国农业生物技术学会副理事长，国际工业微生物遗传学国际委员会主席（GIM-IC）主席（成立以来第一位华人）。

江南大学党委常委、校长，长江学者特聘教授，江苏特聘教授，中国工程院院士，国家“万人计划”和“百千万人才”人选，国家功能食品工程技术研究中心主任。陈卫院士还兼任国务院学位委员会食品科学与工程学科评议组成员、中国食品科学技术学会乳酸菌分会理事长、益生菌产业技术创新战略联盟理事长、乳业产业技术创新战略联盟副理事长、江苏省食品科学技术学会副理事长，“十二五”国家863计划现代农业领域“食品加工与安全技术”主题专家，863计划重点项目“优良食品微生物高通量筛选与细胞选育技术”首席专家等。